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英伟达始终在布局可以消耗大量算力的赛道。自2023年以来，英伟达开始频繁在AI制药领域投资出手，今年年初，黄仁勋称“学计算机的时代过去了，生命科学才是未来”，一下把又生命科学抬到了全球瞩目的高度，媒体和投资人都在纷纷研究生命科学、生物计算的技术方向，期待能在赛道中找到细分领域也分一杯羹。 在生命科学领域中，有一个正在被低估的技术，就是分子动力学。 分子动力学分是一种发展了几十年的计算机模拟实验方法，它基于经典力学原理，特别是牛顿运动定律，来追踪和预测大量粒子(如原子和分子)在给定条件下的运动和相互作用。 这种方法在物理学、化学、生物学，尤其是生命科学中有着广泛应用，因为它能够科学家在原子和分子层面上研究生物大分子的动态行为，这对于理解生物分子的功能机制、加速新药研发、探索疾病成因及生物技术创新至关重要。 既然分子动力学如此强大，为何几十年来一直被忽视呢？计算效率不足是限制其无法进行商业化的主要原因。 虽然分子动力学模拟可以较为准确的模拟分子的运动，在模拟分子构象、折叠等方面具有较高的准确性，但分子动力学模拟存在两个弊端，首先分子力场计算非常耗时，且参数拟合非常复杂。其次，分子动力学模拟很难在大的生物尺度上进行模拟。 举例来说，人体内典型的大分子蛋白质往往由几十万到上百万个原子构成，假设我们用分子动力学模拟方法计算一个50万原子的蛋白质运动0.001秒的“影片”，哪怕用上1000颗主流CPU并行计算，都需要耗费超过100年的时间。这个巨大的限制让分子动力学的方法在过去一直都没法成为研究界的主流。 其实，英伟达十多年前就致力于为分子动力学模拟加速。早在2007年，位于Urbana-Champaign的美国伊利诺伊大学的研究人员就使用了英伟达的 GPU 产品用于计算生物分子、离子的相互作用，结果是运算速度比过去采用CPU集群提高了100倍。在同一年，英伟达还设计研发出能够使GPU解决复杂计算问题的通用并行计算架构CUDA。CUDA能够加快分子动力学模拟软件AMBER的模拟速度。 而在2013年，分子动力学在计算效率方面的窘境终于迎来了突破性的转机。在这一年，美国D. E. Shaw研究所发布了超级计算机安腾第二代，能够实现在微秒至毫秒级时间段内对蛋白质动态运动的模拟，相当于捕捉到蛋白质运动的动态“影片”。 超级计算机安腾的软硬件设计专为分子动力学加速而生，从硬件层面的芯片、主板、布线，到软件层面的专用软件Desmond的开发，均是由D. E. Shaw研究所特殊设计的。此外，通过特殊定制的ASIC专用芯片，安腾能够尽可能地减少数据的传输和运算，在芯片上精细化地分区域、分精度分配计算不同任务，从而一举突破制约分子模拟速度的瓶颈——原子间相互作用力的计算。这种专用化设计使得安腾在执行MD模拟时的速度比最快的通用超级计算机快1000倍以上，极大地缩短了从药物发现到临床前研究的时间和成本。 这预示着一个属于分子动力学的春天来了。 2016年，超算安腾帮助美国AI制药公司Relay Therapeutics成功研发了一款治疗胆管癌的药物，一举打破了药物研发领域的“双十”魔咒，仅用18个月、不到1亿美金就确认了一款用于治疗胆管癌的高选择性FGFR2抑制剂药物RLY-4008的结构，并且顺利进入了美国FDA的临床II期试验，极大程度地缩短了从药物发现到临床前研究近90%的投入时间和成本。 2020年3月，D.E. Shaw研究所公开了对新冠病毒3CL蛋白酶长达100微秒的分子动力学模拟动画及相关数据，这为科研人员深入理解新冠病毒的生命周期内在机制以及研发针对性的3CL蛋白酶抑制剂提供了极为珍贵的理论支撑。一般而言，如此大规模的模拟项目若依赖现有的顶级超级计算机集群，执行时间会横跨数年之久；但借助于专门用于分子动力学加速的超算安腾，这项艰巨的任务仅在短短数周内高效完成。 可见，在算力突破与专用超算的双重驱动下，分子动力学的应用范围和影响力正在不断扩大。 分子动力学软件市场的增长反映了这一领域的发展势头。据QYResearch市场研究报告显示，得益于技术进步、对药物发现的不断需求增加，以及全球慢性病患者数量的上升，预计2030年全球分子动力学软件市场销售额将达到4.1%的年复合增长率。 此外，分子动力学的影响力不仅深入到医药、生物工程等传统领域，还在新兴的合成生物学、精准医疗、个性化药物设计等方面展现出巨大潜力。这些新兴领域要求对生物分子的交互有更深层次的理解和预测能力，分子动力学模拟正好填补了这一空白，它使得科研人员能够以前所未有的精确度和效率探索分子世界。 在材料研发领域，分子动力学可以帮助科研人员加速新材料研发，特别是在纳米材料、智能材料、以及高性能复合材料的设计与优化。通过模拟原子和分子层面的交互，科研人员能够预测材料的宏观性质，如强度、韧性、导电性和热稳定性，无需经过大量的实验试错过程，加速了从理论到实际应用的转化速度，推动了材料领域的科技进步和产业升级。 分子动力学也在能源领域发挥关键作用，助力科学家设计更高效的太阳能电池和燃料电池，为可持续能源解决方案提供了重要的理论支撑。 可见，随着计算资源与计算效率的不断突破，分子动力学的价值正在逐渐被重新评估与发掘，将成为驱动各行各业实现创新突破的关键技术之一。  森海塞尔品牌宣布，MOMENTUM 4 无线耳机曜金黑 x 宝可梦大集结 京东定制礼盒现已开启预约。定制礼盒中包含一副全新森海塞尔曜金黑MOMENTUM 4… 10月21日，电装在电装(广州南沙)有限公司举办碳中和节能体感教育培训活动。通过此次活动，制动君对电装公司碳中和的战略规划、推进路径、实效量化等方面… 为了感谢和回馈广大消费者对HarmonyOS NEXT的信任与支持，11月5日10:00起，华为将与鸿蒙生态伙伴一起，为首批100万名公测用户陆续提供一系列应用的免费会员权益。升级… 随着人工智能技术的逐渐普及，AI在今年已不是什么新鲜事儿。尤其是作为敢于尝鲜的大学生朋友们，应该都已经体验过了不少神奇的AI应用。随着今年双11的火热进行，众多科技厂商也推出了不少… 以酒载道，共赏书院仁义礼智信之风； 以言立行，共扬君子温良恭俭让之德。 10月31日，2024“君品习酒·中国书院”文化活动在江西九江的白鹿洞书院圆满收官。自此，习酒已携… 10月27日，2024年《大国品牌国牌盛典》在北京水立方隆重举行。此次盛典以“上善若水 未来相见”为主题，汇聚了近200家中国知名企业品牌，共同见证中国品牌的崛起与壮大。作为缝纫设… 11月1日，第二十六届全国性文化、成人用品、保健品博览会(以下简称“性文化博览会”)正式开幕。此次博览会主题为“趣享生活，点亮精彩”，行业论坛、创新创业大会、内衣舞台秀、情… 第七届中国国际进口博览会将于11月5日至10日在上海举办。七年来，三星与进博会携手前行，依托进博会开放合作的平台，在“AI for All”愿景下再启新篇，将全面展示最新技术成果和… 11月4日，随着S90和S75组成的双旗舰车队在浙江金华绿源大学热烈的掌声与礼炮声中缓缓驶入，由绿源经销商自行发起，集团公司各部门全程支持赋能的 “骑迹之旅 跨越山海”… 有句话说“墙多大，就选多大的电视”，现在很多人都在追求大屏观影，期望能够买到一款尺寸更大，视觉冲击力更强的“全面屏”电视。这里需要注意一点，全面屏并非单纯指电视尺寸，而是指电视在设… 时隔一年，名龙堂造amp;Intel粉丝再度齐聚江城武汉秋风又起，在充满艺术气息的华侨城红坊创意设计中心梧桐遮连十里，新品诸君共襄。 10月30日周三下午两点武汉线下的粉丝水友陆… 秋色怡人，正是自驾旅行的黄金季节。许多车主驾驶问界新M5踏上广州、大理、成都和苏州等热门城市的旅程，感受秋日的无限美景。他们用Vlog和美图记录下的旅途，展现了各地的风土人情，令人… 或许遗憾才是青春故事里最令人动容的话题，正如璀璨烟火映照的每个人不一定都是胜者，失意时的回头一望能打动无数观众，也正如每一场漫天金雨洒落之时，总有人在台下不为人知的地方，怔怔地遥望… 11月1日晚,四川广播电视台大楼旁千架无人机腾空而起,为大家献上了一场精彩的视觉盛宴。 这场表演也是四川卫视和云天励飞合作打造低空融媒经济新业态的“首秀”。 日前,四川卫视与云天励… 备受期待的双11越发临近，各大电商平台和厂商也提前开启了促销活动。近日，为了迎接即将到来的双11，三星商城也开启了全新的三星11.11「超级星动 为AI狂欢」主题活动，三星Gala… 在智能技术蓬勃发展的2024年，AI不仅重塑了软件开发的范式，更成为推动产业变革的核心动力。从传统编程向AI辅助编程的转变，从单一应用到智能应用生态的演进，再到大模型、具身智能等前… 随着新能源车辆的渗透率逐年增大，电动汽车的使用安全需要得到关注。研究表明，由于我国复杂多变的道路环境，底部刮蹭和撞击引起的电池包受损是造成电动汽车起火的重要原因之一。 据了解，绝大… 近年来，电视行业快速发展，而艺术电视则成为了消费者追求生活品质、展现个性风格的新选择。三星Lifestyle艺术电视将前沿美学融入现代人居空间，不断开拓兼具生活实用性与艺术美感的电… 随着《中华人民共和国个人信息保护法》迎来了实施三周年的重要里程碑，我们不禁要问:隐私安全是否迎来了曙光？在“个保法”三周年之际，让我们一起审视互联网平台作为“… 这个人很懒，什么都没有留下～
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